Bioinformatyk NGS

MNM Diagnostics poszukuje utalentowanego i doświadczonego Bioinformatyka NGS do wzmocnienia naszego zespołu badawczo-rozwojowego. Jeśli Twoją pasją jest praca z danymi genetycznymi nowej generacji, rozwój innowacyjnych narzędzi bioinformatycznych i chcesz mieć realny wpływ na postęp w diagnostyce medycznej, ta oferta jest dla Ciebie!

Na tym stanowisku będziesz odpowiedzialny za analizę, interpretację i walidację danych uzyskanych z sekwencjonowania nowej generacji (NGS), tworzenie i optymalizację pipeline'ów bioinformatycznych oraz wsparcie w opracowywaniu nowych testów diagnostycznych.

Zakres Obowiązków:

• Projektowanie, implementacja i optymalizacja pipeline'ów bioinformatycznych do analizy danych NGS (Whole Genome Sequencing, Whole Exome Sequencing, RNA-Seq, Metagenomics itp.).
• Analiza i interpretacja dużych zbiorów danych genomowych i transkryptomowych.
• Wykrywanie i adnotacja wariantów genetycznych (SNV, indel, CNV) oraz analiza ekspresji genów.
• Walidacja wyników bioinformatycznych z wykorzystaniem danych referencyjnych i baz danych.
• Współpraca z biologami, genetykami i klinicystami w celu przełożenia wyników analiz na wnioski diagnostyczne i badawcze.
• Utrzymywanie i rozwijanie wewnętrznej infrastruktury bioinformatycznej.
• Tworzenie kompleksowych raportów i wizualizacji danych.
• Monitorowanie najnowszych osiągnięć w dziedzinie bioinformatyki i NGS oraz ich wdrażanie.

Wymagania:

• Wykształcenie wyższe (magister, doktorat) w dziedzinie bioinformatyki, genetyki, biologii obliczeniowej lub pokrewnych.
• Min. 3 lata doświadczenia w pracy z danymi NGS, w tym praktyczna znajomość narzędzi do analizy (np. BWA, GATK, samtools, bedtools, DESeq2, kallisto).
• Biegła znajomość programowania w językach takich jak Python lub R, oraz umiejętność pracy w środowisku Linux/Unix (Bash scripting).
• Głębokie zrozumienie podstaw genetyki molekularnej, genomiki i statystyki.
• Doświadczenie w pracy z bazami danych genetycznych (np. ClinVar, gnomAD, Ensembl, UCSC Genome Browser).
• Zdolność do samodzielnego rozwiązywania problemów i analitycznego myślenia.
• Dobra znajomość języka angielskiego w mowie i piśmie (praca z literaturą naukową, komunikacja międzynarodowa).
• Umiejętność efektywnej pracy w zespole oraz doskonałe umiejętności komunikacyjne.
• Doświadczenie z systemami zarządzania przepływem pracy (workflow managers, np. Snakemake, Nextflow, Cromwell) będzie dodatkowym atutem.

Oferujemy:

• Stabilne zatrudnienie w innowacyjnej firmie medycznej, aktywnie działającej na polu diagnostyki genetycznej.
• Możliwość realnego wpływu na rozwój nowoczesnych technologii medycznych.
• Pracę w dynamicznym, interdyscyplinarnym i wspierającym zespole.
• Atrakcyjny pakiet benefitów (prywatna opieka medyczna, karta sportowa, ubezpieczenie na życie, szkolenia).
• Szerokie możliwości rozwoju zawodowego i naukowego.
• Dostęp do najnowocześniejszych technologii i infrastruktury badawczej.
• Przyjazną atmosferę pracy opartą na współpracy i wzajemnym szacunku.

Jeśli Twoja kandydatura odpowiada naszym oczekiwaniom i jesteś gotowy(a) na nowe wyzwania, prosimy o przesłanie swojego CV wraz z listem motywacyjnym na adres: kariera@mnm.bio.

W tytule wiadomości prosimy o wpisanie "Bioinformatyk NGS". Zastrzegamy sobie prawo do kontaktu tylko z wybranymi kandydatami.